Çekirdek polisakarit sentezi lipid Ⅳ a'dan başlar. İndirgeyici olmayan glukozaminin C-6' konumunda KDO (çekirdek oligosakarit) eklendikten sonra, heptoz ve heksoz kademeli olarak eklenir.

1. KDO'nun sentezi ve adezyonu

KDO sentezi üç sürekli reaksiyon içerir: ① 5-fosfat D-riboz ↔ 5-Fosfo-D-arabinoz. ② 5-fosfat - D-arabinoz fosfoenolpiruvat → 8-fosfat - KDO fosfat. ③ 8-fosfat - KDO alkanoik asit. Bu üç reaksiyon, sırasıyla 5-fosfo-D-nükleat izomeraz, 8-fosfor-KDO sentetaz ve 8-fosfataz katalizi altında gerçekleştirildi. Çocuğun kromozomun 27. dakikasında bulunan geni, 8-fosfor-KDO sentetazı kodlar.

KDO, CMP-KDO sentetazın katalizi altında CMP-KDO ile aktive edilmiş form üretir. Bu reaksiyonu katalize eden enzim, bir kromozomun 85. dakikasında yer alan kds B geni tarafından kodlanmaktadır. CMP-KDO, çift işlevli veya üç işlevli protein WaaA'nın katalizi altında KDO'yu lipit Ⅳa'nın C-6'sına bağlar ve ardından ikinci KDO molekülünü birinci KDO molekülüne ekler.

2. Heptoz ve heksoz bölgelerinin sentezi

ADP aktivasyonu şeklinde heptoz ve UDP aktivasyonu şeklinde heksoz teker teker çekirdek polisakarite eklenir. Nükleotit monosakkaritleri katalize eden glikosiltransferazlar, şeker gruplarını hücre zarının sitoplazmik yüzeyindeki olgun lipit A moleküllerine aktaran bir dizi zarla ilgili glikosiltransferazlara aittir. Lipit A'nın sentezlenen çekirdek molekülü, ABC taşıma cihazının [ATP bağlayıcı kaset (ABC) taşıyıcı] katılımıyla hücre zarının sitoplazmik yüzeyinden hücre zarının periplazmik yüzeyine aktarılabilir ve bağlantı reaksiyonunu tamamlayabilir. tam bir LPS molekülü oluşturmak için periplazmik yüzeyde O antijeni polisakarit zinciri ile. Ek olarak, lipit A çekirdeği, enterobakteriyel ortak antijen (ECA) reseptörü ve Escherichia coli grubunun kapsüler K antijeninin polisakkarit zinciri olarak da kullanılabilir.

Çekirdek polisakkaritlerin sentezinde yer alan glikosiltransferazlar veya modifiye edici enzimler, cysE ve pyrE genleri arasında, kromozomun 81-82. . Escherichia coli'nin beş çekirdek yapısı için, farklı çekirdek sentezlerinin gen bileşimi ve genetik dağılımı farklıdır.

waaA operonu, iki işlevli veya üç işlevli bir KDO transferazı kodlayan waaA yapısal genini ve bilinmeyen bir işleve ve 18000 bağıl moleküler ağırlığa sahip bir polipeptit genini içerir. gmhD operonundaki gmhD, waaF ve waaC genlerinin ürünleri, sentezle ilgilidir. çekirdek heptoz bölgesinin, waaQ operonu ise dış heksoz bölgesinin sentezi ve çekirdek bölgenin kimyasal modifikasyonu ile ilgilidir. Escherichia coli K-12'de, gmhD operonunun transkripsiyonu bir ısı şoku promotörü tarafından düzenlenir ve hangi operonun transkripsiyonu, operonun yukarısındaki çevrilmemiş bir bölge ve transkripsiyon uzatma faktörü RfaH. tarafından pozitif olarak düzenlenir.