Tipik bağırsak bakteriyel lipid A, omurga olarak 1,4-difosfat- β 1,6 bağlı glikozaminodisakkaritler ve amid ve ester bağları ile bağlı 3-hidroksi yağ asitleri veya 3-asil karboksil kalıntılarıdır. Bu yapı tüm gram negatif bakterilerde ortak değildir. Özellikle Bradyrhizobia gibi koliform bakterilerden uzak ailelerde yukarıdaki yapılara sıklıkla rastlanmaz.

İlk başta, türetilen lipid A'nın yapısı "anormal" bir lipid A tipi olarak kabul edildi ve şimdi lipid A varyantı olarak yeniden adlandırıldı. Örneğin Thiobacillus, Rhizobiaceae, Nitrobacter, Brucella, Chromatim Party, Chlorobium N adson, vs. LPS'nin iskelet yapısında ve ikamesinde bariz değişiklikler vardır. Lipit A varyantı, Rhodobacter sphaeroides'te geçiş tipi (veya dönüştürülmüş) bir forma sahiptir, amit bağlantılı 3-hidroksi yağ asidinin sadece bir kısmı 3-oksimiristik asit ile değiştirilir. Bir lipit olarak, A iskelet polisakarit, pigmentli bakterilerin glikozaminine her zaman az miktarda 2,3-diamino-2,3-dideoksi-D-glikoz (DAG) bağlantısı eşlik eder.

DAG sadece lipit A iskelet şekerinde bulunur. 2,3-diamin-2,3-dideoksheksozun üronik asit türevinin, Pseudomonas aeruginosa'nın farklı serotiplerinin bir bakteriyel antijeni (O zinciri) olduğu bildirilmiştir.

3- oksimiristik asit: 3-oksimiristik asidin varlığı ilk olarak Listenella anguillarum ve eritroid bakterisinde bildirilmiştir. Şimdi, aslında, gram-negatif bakterilerin tüm türleri ve suşları α-3 dalları gözlemlenebilir.

En önemli biyolojik etkiye sahip endotoksin, genellikle hücre reaksiyonunu test etmek ve terapötik etki üzerine araştırma yapmak için standart olarak kullanılan heterojen LPS'dir. Lipid A'nın biyolojik aktivite kısmı, D-glukozamin disakkarit ve altı doymuş yağ asidi ve iki negatif yüklü fosfat radikalinden oluşan β-1,6'dan oluşur. Yük sayısının azalması, yağ asil gruplarının azalması, yağ asil zincirlerinin dağılımının değişmesi ve yağ asil doygunluğunun derecesi gibi bu yapıların düzenindeki değişiklikler biyolojik yapılarının azalmasına neden olabilir. faaliyetler. Endotoksinin birincil yapısındaki değişikliğin kaçınılmaz olarak fizikokimyasal etkisini etkileyeceğini göstermektedir. Seydel ve ark. LPS'nin endotoksin içindeki stereo yapısının biyolojik etkileriyle yakından ilişkili olduğunu doğruladı. Farklı üç boyutlu yapılar farklı etkiler üretebilir. Genel olarak konuşursak, konik uzamsal yapı genellikle hücrelerin aktivasyon etkisine yol açarken, LPS'nin silindirik uzamsal yapısı genellikle hücrelerin aktivasyonunu engellemek için bir endotoksin antagonistidir.