O antijeninin yapısı çeşitli olmakla birlikte sentezi sitoplazmik yüzeyde gerçekleştirilir. İlk olarak, şeker grubu, nükleosit difosfat monosakkarit öncüsü aracılığıyla zar bağlayıcı lipid GCL'ye (glikol-taşıyıcı lipid) aktarılır ve ardından yeni O antijeni, periplazmik yüzey üzerinde bağımsız olarak sentezlenen lipid çekirdek yapısına bağlanır.
1. Sentetik yol
O antijen sentez yolu, O antijen tekrar birimi polimerizasyonu sürecinde yer alan bileşenlere, polimerizasyonun yerine ve polisakkarit zincirinin zar boyunca periplazmik boşluğa taşınmasında yer alan bileşenlere ve modlara göre üç kategoriye ayrılabilir. yüzey:
Salmonella typhimurium'un O antijeni tekrar birim sentezi ve polimerizasyonu süreci Şekil 1-6'da gösterilmektedir.
İlk olarak WbaP, galaktoz 1-fosfatın UDP-Gal'den GCL-P'ye transferini katalize ederek GCL-PP-Gal oluşturur ve ardından bir dizi glikosiltransferazın katalizi altında tekrar birimlerinin sentezini tamamlar. Yeni sentezlenen GCL-PP tekrar birimi, sitoplazmik yüzeyden periplazmik interstisyel yüzeye aktarılır ve yeni GCL-PP polimeri, polimeri yeni sentezlenen tekrar birimine aktarmak için verici olarak kullanılır. Polimeri hidrolize eden GCL-PP'nin bir sonraki tekrar birim sentezinden önce, GCL-P'nin rolünü tekrar oynayabilmesi için pirofosforilaz tarafından üretilmesi gerekir.
Shigella ve Escherichia coli K-12'nin bazı O antikorları için, çekirdek polisakarite bağlı şeker grubu Gal yerine GlcNAc'dir. Bu tekrar birimlerinin sentezi UDP-GlcNAc: GCL-P-GlcNAc-1-P transferaz WecA (Rfe) tarafından başlatılır ve tekrar birimlerinin müteakip sentezi ve polimerizasyonu Salmonella typhimurium ile aynıdır.
(2) ABC taşıyıcı bağımlı tip: Bu yol, E. coli O8, O9 ve Klebsiella pneumoniae O1 antijeni gibi genellikle lineer bir homomer olan son derece basit bir yapıya sahip O antijeninin sentezi ile sınırlıdır. Sentez, sitoplazmik yüzey üzerinde WecA tarafından katalize edilen GCL-PP-GlcNAc "primer" oluşumu ile başlatılır. Glikosiltransferaz, polikondensasyon reaksiyonunu gerçekleştirmek için sürekli olarak şeker grubunu büyüyen polimerin indirgeyici olmayan ucuna aktarır. Polikondenzasyon reaksiyonu, yolun katılımını gerektirmez. Glikosiltransferazın özgüllüğü, tekrar eden biriminin yapısını belirler. Sitoplazmik yüzeyde sentezlenen O antijeni, ABC taşıma cihazı aracılığıyla periplazmik boşluk yüzeyine aktarılır ve burada lipit A çekirdeği ile bağlantı reaksiyonu tamamlanır.
(3) Sentaza bağımlı: bu yol yakın zamanda Salmonella O54'te bulundu. O54'ün yapısı bir poli N-asetil mannosamindir (MANNAc). Sentezi ayrıca WecA tarafından sentezlenen "primer" GCL-PP-GlcNAc'yi gerektirir ve ardından WbbF (RfbB) polimerin uzamasını katalize eder. WbbF, transferaz çıkışı ikili işlevine sahip olan ve sentezlenen O antijenini sitoplazmik yüzeyden periplazmik yüzeye aktaran ilerleyici bir glikosiltransferaz veya sentazdır.